Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTT5

SSX7, Protein SSX7, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSX7Q7RTT5 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX7Q7RTT5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX7Q7RTT5 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX7Q7RTT5 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
SSX7Q7RTT5 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SSX7Q7RTT5 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SSX7Q7RTT5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SSX7Q7RTT5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms