Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRADAQ7RTN6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRADAQ7RTN6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
STRADAQ7RTN6 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
STRADAQ7RTN6 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRADAQ7RTN6 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRADAQ7RTN6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRADAQ7RTN6 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRADAQ7RTN6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRADAQ7RTN6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
STRADAQ7RTN6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
STRADAQ7RTN6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRADAQ7RTN6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRADAQ7RTN6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRADAQ7RTN6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
STRADAQ7RTN6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
STRADAQ7RTN6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRADAQ7RTN6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRADAQ7RTN6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRADAQ7RTN6 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRADAQ7RTN6 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRADAQ7RTN6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
STRADAQ7RTN6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
STRADAQ7RTN6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
STRADAQ7RTN6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRADAQ7RTN6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRADAQ7RTN6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
STRADAQ7RTN6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRADAQ7RTN6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRADAQ7RTN6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRADAQ7RTN6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
STRADAQ7RTN6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
STRADAQ7RTN6 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRADAQ7RTN6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRADAQ7RTN6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
STRADAQ7RTN6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRADAQ7RTN6 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRADAQ7RTN6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRADAQ7RTN6 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRADAQ7RTN6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRADAQ7RTN6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRADAQ7RTN6 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRADAQ7RTN6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRADAQ7RTN6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRADAQ7RTN6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
STRADAQ7RTN6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRADAQ7RTN6 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRADAQ7RTN6 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRADAQ7RTN6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRADAQ7RTN6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
STRADAQ7RTN6 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRADAQ7RTN6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRADAQ7RTN6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRADAQ7RTN6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
STRADAQ7RTN6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRADAQ7RTN6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
STRADAQ7RTN6 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STRADAQ7RTN6 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
STRADAQ7RTN6 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRADAQ7RTN6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRADAQ7RTN6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRADAQ7RTN6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRADAQ7RTN6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRADAQ7RTN6 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
STRADAQ7RTN6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
STRADAQ7RTN6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRADAQ7RTN6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRADAQ7RTN6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRADAQ7RTN6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRADAQ7RTN6 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRADAQ7RTN6 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
STRADAQ7RTN6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRADAQ7RTN6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
STRADAQ7RTN6 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
STRADAQ7RTN6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRADAQ7RTN6 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRADAQ7RTN6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
STRADAQ7RTN6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRADAQ7RTN6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRADAQ7RTN6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
STRADAQ7RTN6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRADAQ7RTN6 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRADAQ7RTN6 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRADAQ7RTN6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRADAQ7RTN6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRADAQ7RTN6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
STRADAQ7RTN6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRADAQ7RTN6 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRADAQ7RTN6 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRADAQ7RTN6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRADAQ7RTN6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
STRADAQ7RTN6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
STRADAQ7RTN6 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
STRADAQ7RTN6 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRADAQ7RTN6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRADAQ7RTN6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
STRADAQ7RTN6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRADAQ7RTN6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRADAQ7RTN6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
STRADAQ7RTN6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms