Protein–RNA interactions for Protein: Q76I76

SSH2, Protein phosphatase Slingshot homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH2Q76I76 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SSH2Q76I76 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SSH2Q76I76 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
SSH2Q76I76 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SSH2Q76I76 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SSH2Q76I76 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
SSH2Q76I76 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SSH2Q76I76 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
SSH2Q76I76 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SSH2Q76I76 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
SSH2Q76I76 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
SSH2Q76I76 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SSH2Q76I76 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SSH2Q76I76 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SSH2Q76I76 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SSH2Q76I76 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
SSH2Q76I76 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
SSH2Q76I76 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SSH2Q76I76 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SSH2Q76I76 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
SSH2Q76I76 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SSH2Q76I76 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SSH2Q76I76 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SSH2Q76I76 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
SSH2Q76I76 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SSH2Q76I76 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SSH2Q76I76 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SSH2Q76I76 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
SSH2Q76I76 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
SSH2Q76I76 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SSH2Q76I76 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SSH2Q76I76 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
SSH2Q76I76 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SSH2Q76I76 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SSH2Q76I76 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SSH2Q76I76 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SSH2Q76I76 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SSH2Q76I76 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SSH2Q76I76 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
SSH2Q76I76 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
SSH2Q76I76 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SSH2Q76I76 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
SSH2Q76I76 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SSH2Q76I76 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
SSH2Q76I76 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
SSH2Q76I76 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SSH2Q76I76 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
SSH2Q76I76 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SSH2Q76I76 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SSH2Q76I76 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
SSH2Q76I76 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SSH2Q76I76 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
SSH2Q76I76 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SSH2Q76I76 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
SSH2Q76I76 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
SSH2Q76I76 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SSH2Q76I76 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
SSH2Q76I76 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
SSH2Q76I76 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC33.15■■■□□ 2.9
SSH2Q76I76 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SSH2Q76I76 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC33.14■■■□□ 2.9
SSH2Q76I76 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SSH2Q76I76 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SSH2Q76I76 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SSH2Q76I76 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SSH2Q76I76 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
SSH2Q76I76 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SSH2Q76I76 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SSH2Q76I76 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.89
SSH2Q76I76 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SSH2Q76I76 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SSH2Q76I76 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SSH2Q76I76 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
SSH2Q76I76 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SSH2Q76I76 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
SSH2Q76I76 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
SSH2Q76I76 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SSH2Q76I76 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
SSH2Q76I76 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC33.12■■■□□ 2.89
SSH2Q76I76 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SSH2Q76I76 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SSH2Q76I76 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
SSH2Q76I76 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
SSH2Q76I76 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SSH2Q76I76 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
SSH2Q76I76 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SSH2Q76I76 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SSH2Q76I76 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SSH2Q76I76 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SSH2Q76I76 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SSH2Q76I76 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SSH2Q76I76 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
SSH2Q76I76 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SSH2Q76I76 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SSH2Q76I76 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SSH2Q76I76 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SSH2Q76I76 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
SSH2Q76I76 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC33.07■■■□□ 2.89
SSH2Q76I76 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
SSH2Q76I76 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC33.07■■■□□ 2.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms