Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
FAM47EQ6ZV65 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
FAM47EQ6ZV65 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
FAM47EQ6ZV65 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.1 ms