Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSA7

LRRC55, Leucine-rich repeat-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC55Q6ZSA7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC55Q6ZSA7 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC55Q6ZSA7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC55Q6ZSA7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC55Q6ZSA7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
LRRC55Q6ZSA7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC55Q6ZSA7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC55Q6ZSA7 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC55Q6ZSA7 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC55Q6ZSA7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC55Q6ZSA7 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC55Q6ZSA7 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC55Q6ZSA7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC55Q6ZSA7 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC55Q6ZSA7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC55Q6ZSA7 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
LRRC55Q6ZSA7 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
LRRC55Q6ZSA7 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC55Q6ZSA7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC55Q6ZSA7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC55Q6ZSA7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC55Q6ZSA7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC55Q6ZSA7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC55Q6ZSA7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LRRC55Q6ZSA7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC55Q6ZSA7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC55Q6ZSA7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LRRC55Q6ZSA7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC55Q6ZSA7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC55Q6ZSA7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC55Q6ZSA7 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC55Q6ZSA7 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC55Q6ZSA7 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LRRC55Q6ZSA7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC55Q6ZSA7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC55Q6ZSA7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC55Q6ZSA7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC55Q6ZSA7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC55Q6ZSA7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC55Q6ZSA7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC55Q6ZSA7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC55Q6ZSA7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC55Q6ZSA7 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC55Q6ZSA7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LRRC55Q6ZSA7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC55Q6ZSA7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC55Q6ZSA7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LRRC55Q6ZSA7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC55Q6ZSA7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC55Q6ZSA7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LRRC55Q6ZSA7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC55Q6ZSA7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC55Q6ZSA7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LRRC55Q6ZSA7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC55Q6ZSA7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC55Q6ZSA7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC55Q6ZSA7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC55Q6ZSA7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LRRC55Q6ZSA7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC55Q6ZSA7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC55Q6ZSA7 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC55Q6ZSA7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC55Q6ZSA7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC55Q6ZSA7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LRRC55Q6ZSA7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC55Q6ZSA7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC55Q6ZSA7 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC55Q6ZSA7 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LRRC55Q6ZSA7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC55Q6ZSA7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC55Q6ZSA7 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC55Q6ZSA7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC55Q6ZSA7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
LRRC55Q6ZSA7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC55Q6ZSA7 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC55Q6ZSA7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC55Q6ZSA7 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC55Q6ZSA7 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC55Q6ZSA7 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC55Q6ZSA7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC55Q6ZSA7 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC55Q6ZSA7 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC55Q6ZSA7 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LRRC55Q6ZSA7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC55Q6ZSA7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC55Q6ZSA7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
LRRC55Q6ZSA7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
LRRC55Q6ZSA7 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC55Q6ZSA7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC55Q6ZSA7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC55Q6ZSA7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
LRRC55Q6ZSA7 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC55Q6ZSA7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC55Q6ZSA7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC55Q6ZSA7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC55Q6ZSA7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC55Q6ZSA7 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC55Q6ZSA7 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
LRRC55Q6ZSA7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
LRRC55Q6ZSA7 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms