Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW60

PCSK4, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 4, humanhuman

Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK4Q6UW60 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK4Q6UW60 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK4Q6UW60 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK4Q6UW60 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK4Q6UW60 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK4Q6UW60 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK4Q6UW60 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK4Q6UW60 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PCSK4Q6UW60 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK4Q6UW60 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK4Q6UW60 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK4Q6UW60 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK4Q6UW60 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK4Q6UW60 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK4Q6UW60 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK4Q6UW60 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PCSK4Q6UW60 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK4Q6UW60 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK4Q6UW60 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK4Q6UW60 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PCSK4Q6UW60 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PCSK4Q6UW60 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PCSK4Q6UW60 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms