Protein–RNA interactions for Protein: Q6UB28

METAP1D, Methionine aminopeptidase 1D, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
METAP1DQ6UB28 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.29■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.28■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.28■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.27■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
METAP1DQ6UB28 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.2■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
METAP1DQ6UB28 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
METAP1DQ6UB28 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.5 ms