Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
TRAF7Q6Q0C0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAF7Q6Q0C0 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAF7Q6Q0C0 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAF7Q6Q0C0 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAF7Q6Q0C0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
TRAF7Q6Q0C0 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRAF7Q6Q0C0 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
TRAF7Q6Q0C0 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAF7Q6Q0C0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
TRAF7Q6Q0C0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAF7Q6Q0C0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAF7Q6Q0C0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAF7Q6Q0C0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
TRAF7Q6Q0C0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAF7Q6Q0C0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAF7Q6Q0C0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAF7Q6Q0C0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAF7Q6Q0C0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAF7Q6Q0C0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
TRAF7Q6Q0C0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAF7Q6Q0C0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAF7Q6Q0C0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAF7Q6Q0C0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAF7Q6Q0C0 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAF7Q6Q0C0 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
TRAF7Q6Q0C0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAF7Q6Q0C0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAF7Q6Q0C0 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAF7Q6Q0C0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAF7Q6Q0C0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAF7Q6Q0C0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TRAF7Q6Q0C0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAF7Q6Q0C0 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAF7Q6Q0C0 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAF7Q6Q0C0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
TRAF7Q6Q0C0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAF7Q6Q0C0 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAF7Q6Q0C0 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TRAF7Q6Q0C0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TRAF7Q6Q0C0 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TRAF7Q6Q0C0 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAF7Q6Q0C0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAF7Q6Q0C0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAF7Q6Q0C0 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAF7Q6Q0C0 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAF7Q6Q0C0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
TRAF7Q6Q0C0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAF7Q6Q0C0 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAF7Q6Q0C0 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAF7Q6Q0C0 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAF7Q6Q0C0 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAF7Q6Q0C0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAF7Q6Q0C0 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAF7Q6Q0C0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAF7Q6Q0C0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TRAF7Q6Q0C0 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAF7Q6Q0C0 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAF7Q6Q0C0 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAF7Q6Q0C0 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAF7Q6Q0C0 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAF7Q6Q0C0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TRAF7Q6Q0C0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAF7Q6Q0C0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAF7Q6Q0C0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAF7Q6Q0C0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAF7Q6Q0C0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TRAF7Q6Q0C0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAF7Q6Q0C0 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAF7Q6Q0C0 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAF7Q6Q0C0 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAF7Q6Q0C0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAF7Q6Q0C0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TRAF7Q6Q0C0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAF7Q6Q0C0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAF7Q6Q0C0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TRAF7Q6Q0C0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAF7Q6Q0C0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAF7Q6Q0C0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAF7Q6Q0C0 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAF7Q6Q0C0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAF7Q6Q0C0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAF7Q6Q0C0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAF7Q6Q0C0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAF7Q6Q0C0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TRAF7Q6Q0C0 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAF7Q6Q0C0 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAF7Q6Q0C0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TRAF7Q6Q0C0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAF7Q6Q0C0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAF7Q6Q0C0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAF7Q6Q0C0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TRAF7Q6Q0C0 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAF7Q6Q0C0 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAF7Q6Q0C0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAF7Q6Q0C0 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAF7Q6Q0C0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRAF7Q6Q0C0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRAF7Q6Q0C0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms