Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5X7

TMEM71, Transmembrane protein 71, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM71Q6P5X7 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMEM71Q6P5X7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TMEM71Q6P5X7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMEM71Q6P5X7 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms