Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC27A4Q6P1M0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC27A4Q6P1M0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC27A4Q6P1M0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms