Protein–RNA interactions for Protein: Q69YQ0

SPECC1L, Cytospin-A, humanhuman

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPECC1LQ69YQ0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPECC1LQ69YQ0 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPECC1LQ69YQ0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPECC1LQ69YQ0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPECC1LQ69YQ0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPECC1LQ69YQ0 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPECC1LQ69YQ0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPECC1LQ69YQ0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPECC1LQ69YQ0 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPECC1LQ69YQ0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SPECC1LQ69YQ0 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SPECC1LQ69YQ0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SPECC1LQ69YQ0 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SPECC1LQ69YQ0 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms