Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZ18

SHE, SH2 domain-containing adapter protein E, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHEQ5VZ18 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SHEQ5VZ18 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
SHEQ5VZ18 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SHEQ5VZ18 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms