Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX52

SPATA1, Spermatogenesis-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA1Q5VX52 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SPATA1Q5VX52 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPATA1Q5VX52 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPATA1Q5VX52 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPATA1Q5VX52 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPATA1Q5VX52 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPATA1Q5VX52 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SPATA1Q5VX52 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SPATA1Q5VX52 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPATA1Q5VX52 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPATA1Q5VX52 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPATA1Q5VX52 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SPATA1Q5VX52 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SPATA1Q5VX52 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPATA1Q5VX52 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPATA1Q5VX52 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPATA1Q5VX52 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPATA1Q5VX52 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SPATA1Q5VX52 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPATA1Q5VX52 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPATA1Q5VX52 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPATA1Q5VX52 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPATA1Q5VX52 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPATA1Q5VX52 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SPATA1Q5VX52 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPATA1Q5VX52 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SPATA1Q5VX52 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SPATA1Q5VX52 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPATA1Q5VX52 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SPATA1Q5VX52 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPATA1Q5VX52 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPATA1Q5VX52 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPATA1Q5VX52 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPATA1Q5VX52 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SPATA1Q5VX52 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPATA1Q5VX52 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPATA1Q5VX52 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SPATA1Q5VX52 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPATA1Q5VX52 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPATA1Q5VX52 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPATA1Q5VX52 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SPATA1Q5VX52 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPATA1Q5VX52 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPATA1Q5VX52 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SPATA1Q5VX52 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPATA1Q5VX52 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPATA1Q5VX52 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPATA1Q5VX52 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPATA1Q5VX52 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPATA1Q5VX52 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
SPATA1Q5VX52 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPATA1Q5VX52 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SPATA1Q5VX52 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPATA1Q5VX52 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPATA1Q5VX52 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPATA1Q5VX52 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPATA1Q5VX52 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
SPATA1Q5VX52 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPATA1Q5VX52 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPATA1Q5VX52 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPATA1Q5VX52 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPATA1Q5VX52 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SPATA1Q5VX52 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPATA1Q5VX52 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPATA1Q5VX52 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
SPATA1Q5VX52 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPATA1Q5VX52 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPATA1Q5VX52 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
SPATA1Q5VX52 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPATA1Q5VX52 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPATA1Q5VX52 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPATA1Q5VX52 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPATA1Q5VX52 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPATA1Q5VX52 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPATA1Q5VX52 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPATA1Q5VX52 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPATA1Q5VX52 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPATA1Q5VX52 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPATA1Q5VX52 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
SPATA1Q5VX52 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPATA1Q5VX52 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPATA1Q5VX52 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPATA1Q5VX52 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPATA1Q5VX52 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPATA1Q5VX52 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPATA1Q5VX52 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPATA1Q5VX52 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPATA1Q5VX52 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPATA1Q5VX52 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SPATA1Q5VX52 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPATA1Q5VX52 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPATA1Q5VX52 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPATA1Q5VX52 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPATA1Q5VX52 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPATA1Q5VX52 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPATA1Q5VX52 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPATA1Q5VX52 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPATA1Q5VX52 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPATA1Q5VX52 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPATA1Q5VX52 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms