Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF38BQ5VTL8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF38BQ5VTL8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF38BQ5VTL8 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF38BQ5VTL8 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF38BQ5VTL8 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF38BQ5VTL8 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF38BQ5VTL8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PRPF38BQ5VTL8 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF38BQ5VTL8 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF38BQ5VTL8 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF38BQ5VTL8 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PRPF38BQ5VTL8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF38BQ5VTL8 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF38BQ5VTL8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
PRPF38BQ5VTL8 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF38BQ5VTL8 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
PRPF38BQ5VTL8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF38BQ5VTL8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF38BQ5VTL8 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF38BQ5VTL8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF38BQ5VTL8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
PRPF38BQ5VTL8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF38BQ5VTL8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF38BQ5VTL8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF38BQ5VTL8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF38BQ5VTL8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF38BQ5VTL8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
PRPF38BQ5VTL8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF38BQ5VTL8 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF38BQ5VTL8 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF38BQ5VTL8 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF38BQ5VTL8 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF38BQ5VTL8 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF38BQ5VTL8 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF38BQ5VTL8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF38BQ5VTL8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF38BQ5VTL8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PRPF38BQ5VTL8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF38BQ5VTL8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF38BQ5VTL8 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF38BQ5VTL8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF38BQ5VTL8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PRPF38BQ5VTL8 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
PRPF38BQ5VTL8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRPF38BQ5VTL8 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRPF38BQ5VTL8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PRPF38BQ5VTL8 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF38BQ5VTL8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF38BQ5VTL8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PRPF38BQ5VTL8 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF38BQ5VTL8 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF38BQ5VTL8 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
PRPF38BQ5VTL8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF38BQ5VTL8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PRPF38BQ5VTL8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF38BQ5VTL8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF38BQ5VTL8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF38BQ5VTL8 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PRPF38BQ5VTL8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF38BQ5VTL8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF38BQ5VTL8 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF38BQ5VTL8 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PRPF38BQ5VTL8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF38BQ5VTL8 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF38BQ5VTL8 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF38BQ5VTL8 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF38BQ5VTL8 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF38BQ5VTL8 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PRPF38BQ5VTL8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF38BQ5VTL8 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF38BQ5VTL8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PRPF38BQ5VTL8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF38BQ5VTL8 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF38BQ5VTL8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF38BQ5VTL8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PRPF38BQ5VTL8 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF38BQ5VTL8 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF38BQ5VTL8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF38BQ5VTL8 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PRPF38BQ5VTL8 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF38BQ5VTL8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF38BQ5VTL8 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF38BQ5VTL8 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF38BQ5VTL8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRPF38BQ5VTL8 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF38BQ5VTL8 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF38BQ5VTL8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRPF38BQ5VTL8 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF38BQ5VTL8 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF38BQ5VTL8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF38BQ5VTL8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRPF38BQ5VTL8 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRPF38BQ5VTL8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.3 ms