Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NUP188Q5SRE5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NUP188Q5SRE5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
NUP188Q5SRE5 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC31.92■■■□□ 2.7
NUP188Q5SRE5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
NUP188Q5SRE5 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
NUP188Q5SRE5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NUP188Q5SRE5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NUP188Q5SRE5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
NUP188Q5SRE5 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NUP188Q5SRE5 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NUP188Q5SRE5 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
NUP188Q5SRE5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NUP188Q5SRE5 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
NUP188Q5SRE5 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
NUP188Q5SRE5 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.69
NUP188Q5SRE5 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NUP188Q5SRE5 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
NUP188Q5SRE5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NUP188Q5SRE5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
NUP188Q5SRE5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NUP188Q5SRE5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC31.87■■■□□ 2.69
NUP188Q5SRE5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NUP188Q5SRE5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NUP188Q5SRE5 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NUP188Q5SRE5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
NUP188Q5SRE5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NUP188Q5SRE5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
NUP188Q5SRE5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NUP188Q5SRE5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
NUP188Q5SRE5 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NUP188Q5SRE5 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
NUP188Q5SRE5 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NUP188Q5SRE5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
NUP188Q5SRE5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
NUP188Q5SRE5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
NUP188Q5SRE5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
NUP188Q5SRE5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
NUP188Q5SRE5 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NUP188Q5SRE5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NUP188Q5SRE5 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC31.82■■■□□ 2.68
NUP188Q5SRE5 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
NUP188Q5SRE5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
NUP188Q5SRE5 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NUP188Q5SRE5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
NUP188Q5SRE5 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NUP188Q5SRE5 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NUP188Q5SRE5 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
NUP188Q5SRE5 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
NUP188Q5SRE5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NUP188Q5SRE5 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NUP188Q5SRE5 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
NUP188Q5SRE5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NUP188Q5SRE5 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
NUP188Q5SRE5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
NUP188Q5SRE5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
NUP188Q5SRE5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
NUP188Q5SRE5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NUP188Q5SRE5 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NUP188Q5SRE5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NUP188Q5SRE5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
NUP188Q5SRE5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC31.77■■■□□ 2.68
NUP188Q5SRE5 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
NUP188Q5SRE5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NUP188Q5SRE5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
NUP188Q5SRE5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NUP188Q5SRE5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.75■■■□□ 2.67
NUP188Q5SRE5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
NUP188Q5SRE5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC31.75■■■□□ 2.67
NUP188Q5SRE5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NUP188Q5SRE5 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NUP188Q5SRE5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
NUP188Q5SRE5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NUP188Q5SRE5 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NUP188Q5SRE5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NUP188Q5SRE5 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
NUP188Q5SRE5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
NUP188Q5SRE5 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NUP188Q5SRE5 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NUP188Q5SRE5 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NUP188Q5SRE5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
NUP188Q5SRE5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
NUP188Q5SRE5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NUP188Q5SRE5 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC31.71■■■□□ 2.67
NUP188Q5SRE5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
NUP188Q5SRE5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
NUP188Q5SRE5 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NUP188Q5SRE5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
NUP188Q5SRE5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
NUP188Q5SRE5 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NUP188Q5SRE5 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NUP188Q5SRE5 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NUP188Q5SRE5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NUP188Q5SRE5 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
NUP188Q5SRE5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
NUP188Q5SRE5 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
NUP188Q5SRE5 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
NUP188Q5SRE5 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC31.69■■■□□ 2.66
NUP188Q5SRE5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
NUP188Q5SRE5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms