Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VAX1Q5SQQ9 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAX1Q5SQQ9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAX1Q5SQQ9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAX1Q5SQQ9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAX1Q5SQQ9 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAX1Q5SQQ9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAX1Q5SQQ9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VAX1Q5SQQ9 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAX1Q5SQQ9 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAX1Q5SQQ9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAX1Q5SQQ9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAX1Q5SQQ9 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAX1Q5SQQ9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VAX1Q5SQQ9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAX1Q5SQQ9 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
VAX1Q5SQQ9 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAX1Q5SQQ9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VAX1Q5SQQ9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAX1Q5SQQ9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAX1Q5SQQ9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAX1Q5SQQ9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAX1Q5SQQ9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAX1Q5SQQ9 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VAX1Q5SQQ9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAX1Q5SQQ9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAX1Q5SQQ9 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAX1Q5SQQ9 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAX1Q5SQQ9 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAX1Q5SQQ9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VAX1Q5SQQ9 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
VAX1Q5SQQ9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
VAX1Q5SQQ9 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms