Protein–RNA interactions for Protein: Q5RKV6

EXOSC6, Exosome complex component MTR3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC6Q5RKV6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC6Q5RKV6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC6Q5RKV6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC6Q5RKV6 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC6Q5RKV6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC6Q5RKV6 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
EXOSC6Q5RKV6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC6Q5RKV6 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC6Q5RKV6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC6Q5RKV6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC6Q5RKV6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
EXOSC6Q5RKV6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC6Q5RKV6 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC6Q5RKV6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC6Q5RKV6 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
EXOSC6Q5RKV6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC6Q5RKV6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC6Q5RKV6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC6Q5RKV6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC6Q5RKV6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC6Q5RKV6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
EXOSC6Q5RKV6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC6Q5RKV6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC6Q5RKV6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC6Q5RKV6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC6Q5RKV6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC6Q5RKV6 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
EXOSC6Q5RKV6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC6Q5RKV6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC6Q5RKV6 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC6Q5RKV6 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
EXOSC6Q5RKV6 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC6Q5RKV6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC6Q5RKV6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
EXOSC6Q5RKV6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC6Q5RKV6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC6Q5RKV6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC6Q5RKV6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC6Q5RKV6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC6Q5RKV6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC6Q5RKV6 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC6Q5RKV6 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC6Q5RKV6 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC6Q5RKV6 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
EXOSC6Q5RKV6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC6Q5RKV6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC6Q5RKV6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC6Q5RKV6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC6Q5RKV6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC6Q5RKV6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC6Q5RKV6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
EXOSC6Q5RKV6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC6Q5RKV6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC6Q5RKV6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
EXOSC6Q5RKV6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC6Q5RKV6 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC6Q5RKV6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC6Q5RKV6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC6Q5RKV6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC6Q5RKV6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC6Q5RKV6 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC6Q5RKV6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
EXOSC6Q5RKV6 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
EXOSC6Q5RKV6 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms