Protein–RNA interactions for Protein: Q5HYI8

RABL3, Rab-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABL3Q5HYI8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RABL3Q5HYI8 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABL3Q5HYI8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABL3Q5HYI8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABL3Q5HYI8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABL3Q5HYI8 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABL3Q5HYI8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABL3Q5HYI8 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RABL3Q5HYI8 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABL3Q5HYI8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABL3Q5HYI8 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABL3Q5HYI8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RABL3Q5HYI8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABL3Q5HYI8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABL3Q5HYI8 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABL3Q5HYI8 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RABL3Q5HYI8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABL3Q5HYI8 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABL3Q5HYI8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABL3Q5HYI8 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RABL3Q5HYI8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABL3Q5HYI8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABL3Q5HYI8 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RABL3Q5HYI8 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABL3Q5HYI8 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABL3Q5HYI8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABL3Q5HYI8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABL3Q5HYI8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABL3Q5HYI8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RABL3Q5HYI8 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RABL3Q5HYI8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RABL3Q5HYI8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms