Protein–RNA interactions for Protein: Q5EBM0

CMPK2, UMP-CMP kinase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK2Q5EBM0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CMPK2Q5EBM0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CMPK2Q5EBM0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CMPK2Q5EBM0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CMPK2Q5EBM0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMPK2Q5EBM0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMPK2Q5EBM0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMPK2Q5EBM0 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMPK2Q5EBM0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CMPK2Q5EBM0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMPK2Q5EBM0 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMPK2Q5EBM0 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMPK2Q5EBM0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMPK2Q5EBM0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CMPK2Q5EBM0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMPK2Q5EBM0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMPK2Q5EBM0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CMPK2Q5EBM0 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMPK2Q5EBM0 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMPK2Q5EBM0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMPK2Q5EBM0 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMPK2Q5EBM0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CMPK2Q5EBM0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CMPK2Q5EBM0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CMPK2Q5EBM0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CMPK2Q5EBM0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CMPK2Q5EBM0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CMPK2Q5EBM0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CMPK2Q5EBM0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CMPK2Q5EBM0 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CMPK2Q5EBM0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CMPK2Q5EBM0 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CMPK2Q5EBM0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CMPK2Q5EBM0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CMPK2Q5EBM0 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms