Protein–RNA interactions for Protein: Q59EK9

RUNDC3A, RUN domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3AQ59EK9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RUNDC3AQ59EK9 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RUNDC3AQ59EK9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RUNDC3AQ59EK9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms