Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KLHL12Q53G59 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
KLHL12Q53G59 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
KLHL12Q53G59 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.2 ms