Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIN52Q52LA3 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIN52Q52LA3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIN52Q52LA3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIN52Q52LA3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIN52Q52LA3 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LIN52Q52LA3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIN52Q52LA3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
LIN52Q52LA3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN52Q52LA3 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN52Q52LA3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN52Q52LA3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN52Q52LA3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN52Q52LA3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN52Q52LA3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN52Q52LA3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
LIN52Q52LA3 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIN52Q52LA3 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIN52Q52LA3 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIN52Q52LA3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
LIN52Q52LA3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
LIN52Q52LA3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
LIN52Q52LA3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms