Protein–RNA interactions for Protein: Q504U0

C4orf46, Renal cancer differentiation gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf46Q504U0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
C4orf46Q504U0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
C4orf46Q504U0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
C4orf46Q504U0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms