Protein–RNA interactions for Protein: Q4VC39

HIGD2B, Putative HIG1 domain family member 2B, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2BQ4VC39 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HIGD2BQ4VC39 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HIGD2BQ4VC39 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms