Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
TPRNQ4KMQ1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TPRNQ4KMQ1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TPRNQ4KMQ1 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
TPRNQ4KMQ1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
TPRNQ4KMQ1 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TPRNQ4KMQ1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TPRNQ4KMQ1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TPRNQ4KMQ1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TPRNQ4KMQ1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TPRNQ4KMQ1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TPRNQ4KMQ1 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TPRNQ4KMQ1 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TPRNQ4KMQ1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TPRNQ4KMQ1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
TPRNQ4KMQ1 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TPRNQ4KMQ1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TPRNQ4KMQ1 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TPRNQ4KMQ1 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TPRNQ4KMQ1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TPRNQ4KMQ1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TPRNQ4KMQ1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TPRNQ4KMQ1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TPRNQ4KMQ1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
TPRNQ4KMQ1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TPRNQ4KMQ1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TPRNQ4KMQ1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TPRNQ4KMQ1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TPRNQ4KMQ1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TPRNQ4KMQ1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TPRNQ4KMQ1 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TPRNQ4KMQ1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
TPRNQ4KMQ1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TPRNQ4KMQ1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TPRNQ4KMQ1 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
TPRNQ4KMQ1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TPRNQ4KMQ1 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
TPRNQ4KMQ1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TPRNQ4KMQ1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
TPRNQ4KMQ1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TPRNQ4KMQ1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TPRNQ4KMQ1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TPRNQ4KMQ1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TPRNQ4KMQ1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TPRNQ4KMQ1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TPRNQ4KMQ1 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TPRNQ4KMQ1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TPRNQ4KMQ1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TPRNQ4KMQ1 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TPRNQ4KMQ1 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TPRNQ4KMQ1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TPRNQ4KMQ1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
TPRNQ4KMQ1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TPRNQ4KMQ1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TPRNQ4KMQ1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TPRNQ4KMQ1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TPRNQ4KMQ1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TPRNQ4KMQ1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TPRNQ4KMQ1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
TPRNQ4KMQ1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
TPRNQ4KMQ1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TPRNQ4KMQ1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TPRNQ4KMQ1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TPRNQ4KMQ1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TPRNQ4KMQ1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TPRNQ4KMQ1 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TPRNQ4KMQ1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TPRNQ4KMQ1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TPRNQ4KMQ1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TPRNQ4KMQ1 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
TPRNQ4KMQ1 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TPRNQ4KMQ1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
TPRNQ4KMQ1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TPRNQ4KMQ1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TPRNQ4KMQ1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
TPRNQ4KMQ1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
TPRNQ4KMQ1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TPRNQ4KMQ1 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TPRNQ4KMQ1 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TPRNQ4KMQ1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TPRNQ4KMQ1 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TPRNQ4KMQ1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
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