Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
KRTAP21-3Q3LHN1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRTAP21-3Q3LHN1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRTAP21-3Q3LHN1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRTAP21-3Q3LHN1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRTAP21-3Q3LHN1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRTAP21-3Q3LHN1 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRTAP21-3Q3LHN1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRTAP21-3Q3LHN1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRTAP21-3Q3LHN1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRTAP21-3Q3LHN1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
KRTAP21-3Q3LHN1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRTAP21-3Q3LHN1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
KRTAP21-3Q3LHN1 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRTAP21-3Q3LHN1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRTAP21-3Q3LHN1 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
KRTAP21-3Q3LHN1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
KRTAP21-3Q3LHN1 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
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