Protein–RNA interactions for Protein: Q2MJR0

SPRED3, Sprouty-related, EVH1 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED3Q2MJR0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
SPRED3Q2MJR0 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SPRED3Q2MJR0 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SPRED3Q2MJR0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPRED3Q2MJR0 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPRED3Q2MJR0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPRED3Q2MJR0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPRED3Q2MJR0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms