Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
NDUFA9Q16795 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NDUFA9Q16795 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NDUFA9Q16795 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
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