Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SYPL1Q16563 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SYPL1Q16563 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
SYPL1Q16563 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYPL1Q16563 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SYPL1Q16563 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms