Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZFHX3Q15911 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ZFHX3Q15911 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
ZFHX3Q15911 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC20.2■□□□□ 0.83
ZFHX3Q15911 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
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