Protein–RNA interactions for Protein: Q15027

ACAP1, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP1Q15027 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACAP1Q15027 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACAP1Q15027 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACAP1Q15027 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACAP1Q15027 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACAP1Q15027 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ACAP1Q15027 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACAP1Q15027 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACAP1Q15027 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACAP1Q15027 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACAP1Q15027 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACAP1Q15027 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACAP1Q15027 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACAP1Q15027 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACAP1Q15027 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACAP1Q15027 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACAP1Q15027 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACAP1Q15027 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACAP1Q15027 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACAP1Q15027 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACAP1Q15027 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACAP1Q15027 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACAP1Q15027 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACAP1Q15027 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACAP1Q15027 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACAP1Q15027 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACAP1Q15027 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACAP1Q15027 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACAP1Q15027 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACAP1Q15027 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACAP1Q15027 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
ACAP1Q15027 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACAP1Q15027 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACAP1Q15027 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACAP1Q15027 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACAP1Q15027 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ACAP1Q15027 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACAP1Q15027 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ACAP1Q15027 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACAP1Q15027 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACAP1Q15027 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACAP1Q15027 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACAP1Q15027 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACAP1Q15027 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ACAP1Q15027 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ACAP1Q15027 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACAP1Q15027 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACAP1Q15027 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACAP1Q15027 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ACAP1Q15027 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
ACAP1Q15027 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACAP1Q15027 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACAP1Q15027 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACAP1Q15027 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACAP1Q15027 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACAP1Q15027 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ACAP1Q15027 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ACAP1Q15027 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACAP1Q15027 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACAP1Q15027 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACAP1Q15027 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ACAP1Q15027 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms