Protein–RNA interactions for Protein: Q14957

GRIN2C, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, humanhuman

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2CQ14957 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GRIN2CQ14957 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
GRIN2CQ14957 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.79
GRIN2CQ14957 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GRIN2CQ14957 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
GRIN2CQ14957 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2CQ14957 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2CQ14957 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2CQ14957 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2CQ14957 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRIN2CQ14957 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN2CQ14957 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN2CQ14957 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRIN2CQ14957 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN2CQ14957 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN2CQ14957 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN2CQ14957 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN2CQ14957 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRIN2CQ14957 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2CQ14957 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRIN2CQ14957 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
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