Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
GPNMBQ14956 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
GPNMBQ14956 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
GPNMBQ14956 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
GPNMBQ14956 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
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