Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
RBM39Q14498 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
RBM39Q14498 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBM39Q14498 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBM39Q14498 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBM39Q14498 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBM39Q14498 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBM39Q14498 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
RBM39Q14498 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
RBM39Q14498 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
RBM39Q14498 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RBM39Q14498 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
RBM39Q14498 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
RBM39Q14498 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBM39Q14498 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBM39Q14498 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBM39Q14498 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBM39Q14498 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBM39Q14498 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBM39Q14498 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
RBM39Q14498 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
RBM39Q14498 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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