Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CKAP5Q14008 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP5Q14008 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP5Q14008 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP5Q14008 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP5Q14008 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP5Q14008 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP5Q14008 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CKAP5Q14008 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CKAP5Q14008 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKAP5Q14008 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKAP5Q14008 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKAP5Q14008 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKAP5Q14008 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CKAP5Q14008 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKAP5Q14008 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CKAP5Q14008 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKAP5Q14008 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKAP5Q14008 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CKAP5Q14008 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKAP5Q14008 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CKAP5Q14008 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKAP5Q14008 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKAP5Q14008 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKAP5Q14008 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CKAP5Q14008 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKAP5Q14008 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKAP5Q14008 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CKAP5Q14008 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKAP5Q14008 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKAP5Q14008 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKAP5Q14008 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKAP5Q14008 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CKAP5Q14008 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CKAP5Q14008 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKAP5Q14008 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKAP5Q14008 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKAP5Q14008 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CKAP5Q14008 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CKAP5Q14008 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CKAP5Q14008 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CKAP5Q14008 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CKAP5Q14008 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKAP5Q14008 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKAP5Q14008 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKAP5Q14008 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKAP5Q14008 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CKAP5Q14008 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CKAP5Q14008 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CKAP5Q14008 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CKAP5Q14008 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CKAP5Q14008 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CKAP5Q14008 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CKAP5Q14008 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
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CKAP5Q14008 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CKAP5Q14008 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CKAP5Q14008 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
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CKAP5Q14008 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CKAP5Q14008 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CKAP5Q14008 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CKAP5Q14008 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CKAP5Q14008 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CKAP5Q14008 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CKAP5Q14008 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CKAP5Q14008 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CKAP5Q14008 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
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