Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
TNFAIP1Q13829 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNFAIP1Q13829 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNFAIP1Q13829 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNFAIP1Q13829 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TNFAIP1Q13829 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNFAIP1Q13829 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
TNFAIP1Q13829 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNFAIP1Q13829 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
TNFAIP1Q13829 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNFAIP1Q13829 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNFAIP1Q13829 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNFAIP1Q13829 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TNFAIP1Q13829 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNFAIP1Q13829 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNFAIP1Q13829 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNFAIP1Q13829 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNFAIP1Q13829 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNFAIP1Q13829 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNFAIP1Q13829 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TNFAIP1Q13829 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNFAIP1Q13829 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNFAIP1Q13829 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNFAIP1Q13829 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNFAIP1Q13829 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNFAIP1Q13829 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
TNFAIP1Q13829 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TNFAIP1Q13829 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNFAIP1Q13829 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNFAIP1Q13829 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TNFAIP1Q13829 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
TNFAIP1Q13829 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
TNFAIP1Q13829 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNFAIP1Q13829 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNFAIP1Q13829 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNFAIP1Q13829 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNFAIP1Q13829 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNFAIP1Q13829 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNFAIP1Q13829 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNFAIP1Q13829 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNFAIP1Q13829 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TNFAIP1Q13829 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNFAIP1Q13829 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNFAIP1Q13829 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
TNFAIP1Q13829 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNFAIP1Q13829 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TNFAIP1Q13829 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNFAIP1Q13829 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TNFAIP1Q13829 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNFAIP1Q13829 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNFAIP1Q13829 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNFAIP1Q13829 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNFAIP1Q13829 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNFAIP1Q13829 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
TNFAIP1Q13829 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TNFAIP1Q13829 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNFAIP1Q13829 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNFAIP1Q13829 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
TNFAIP1Q13829 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNFAIP1Q13829 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNFAIP1Q13829 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNFAIP1Q13829 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNFAIP1Q13829 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNFAIP1Q13829 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TNFAIP1Q13829 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.2
TNFAIP1Q13829 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNFAIP1Q13829 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNFAIP1Q13829 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
TNFAIP1Q13829 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNFAIP1Q13829 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNFAIP1Q13829 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNFAIP1Q13829 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TNFAIP1Q13829 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNFAIP1Q13829 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNFAIP1Q13829 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNFAIP1Q13829 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TNFAIP1Q13829 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNFAIP1Q13829 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNFAIP1Q13829 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNFAIP1Q13829 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNFAIP1Q13829 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNFAIP1Q13829 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TNFAIP1Q13829 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNFAIP1Q13829 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNFAIP1Q13829 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNFAIP1Q13829 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNFAIP1Q13829 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNFAIP1Q13829 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TNFAIP1Q13829 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNFAIP1Q13829 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TNFAIP1Q13829 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNFAIP1Q13829 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNFAIP1Q13829 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNFAIP1Q13829 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TNFAIP1Q13829 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TNFAIP1Q13829 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNFAIP1Q13829 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNFAIP1Q13829 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TNFAIP1Q13829 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TNFAIP1Q13829 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
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