Protein–RNA interactions for Protein: Q13686

ALKBH1, Nucleic acid dioxygenase ALKBH1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH1Q13686 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALKBH1Q13686 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALKBH1Q13686 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ALKBH1Q13686 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALKBH1Q13686 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALKBH1Q13686 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
ALKBH1Q13686 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALKBH1Q13686 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALKBH1Q13686 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALKBH1Q13686 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALKBH1Q13686 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ALKBH1Q13686 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALKBH1Q13686 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALKBH1Q13686 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALKBH1Q13686 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALKBH1Q13686 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ALKBH1Q13686 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALKBH1Q13686 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALKBH1Q13686 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALKBH1Q13686 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALKBH1Q13686 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ALKBH1Q13686 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC21.14■□□□□ 0.98
ALKBH1Q13686 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ALKBH1Q13686 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ALKBH1Q13686 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ALKBH1Q13686 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALKBH1Q13686 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALKBH1Q13686 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALKBH1Q13686 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALKBH1Q13686 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALKBH1Q13686 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
ALKBH1Q13686 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALKBH1Q13686 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALKBH1Q13686 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALKBH1Q13686 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALKBH1Q13686 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
ALKBH1Q13686 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALKBH1Q13686 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALKBH1Q13686 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
ALKBH1Q13686 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms