Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRR1Q13601 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.11
KRR1Q13601 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
KRR1Q13601 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
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