Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NAE1Q13564 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
NAE1Q13564 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NAE1Q13564 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NAE1Q13564 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
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