Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TUBB3Q13509 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB3Q13509 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB3Q13509 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB3Q13509 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB3Q13509 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB3Q13509 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TUBB3Q13509 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB3Q13509 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TUBB3Q13509 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB3Q13509 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB3Q13509 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB3Q13509 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB3Q13509 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB3Q13509 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB3Q13509 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TUBB3Q13509 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TUBB3Q13509 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TUBB3Q13509 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TUBB3Q13509 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
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