Protein–RNA interactions for Protein: Q13507

TRPC3, Short transient receptor potential channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC3Q13507 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
TRPC3Q13507 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRPC3Q13507 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRPC3Q13507 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRPC3Q13507 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRPC3Q13507 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TRPC3Q13507 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRPC3Q13507 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRPC3Q13507 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRPC3Q13507 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
TRPC3Q13507 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRPC3Q13507 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRPC3Q13507 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TRPC3Q13507 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPC3Q13507 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPC3Q13507 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TRPC3Q13507 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRPC3Q13507 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRPC3Q13507 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRPC3Q13507 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRPC3Q13507 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRPC3Q13507 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRPC3Q13507 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TRPC3Q13507 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRPC3Q13507 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
TRPC3Q13507 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TRPC3Q13507 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
TRPC3Q13507 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TRPC3Q13507 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRPC3Q13507 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRPC3Q13507 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRPC3Q13507 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TRPC3Q13507 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TRPC3Q13507 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRPC3Q13507 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRPC3Q13507 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRPC3Q13507 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
TRPC3Q13507 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRPC3Q13507 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRPC3Q13507 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
TRPC3Q13507 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRPC3Q13507 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRPC3Q13507 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRPC3Q13507 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRPC3Q13507 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRPC3Q13507 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
TRPC3Q13507 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRPC3Q13507 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRPC3Q13507 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRPC3Q13507 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRPC3Q13507 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRPC3Q13507 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRPC3Q13507 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRPC3Q13507 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TRPC3Q13507 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms