Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MTM1Q13496 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTM1Q13496 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTM1Q13496 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MTM1Q13496 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MTM1Q13496 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTM1Q13496 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTM1Q13496 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTM1Q13496 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTM1Q13496 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
MTM1Q13496 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTM1Q13496 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTM1Q13496 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTM1Q13496 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTM1Q13496 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MTM1Q13496 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTM1Q13496 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTM1Q13496 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
MTM1Q13496 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTM1Q13496 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTM1Q13496 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTM1Q13496 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTM1Q13496 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTM1Q13496 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MTM1Q13496 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MTM1Q13496 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTM1Q13496 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTM1Q13496 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MTM1Q13496 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTM1Q13496 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTM1Q13496 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTM1Q13496 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
MTM1Q13496 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTM1Q13496 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTM1Q13496 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MTM1Q13496 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTM1Q13496 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTM1Q13496 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MTM1Q13496 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTM1Q13496 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTM1Q13496 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTM1Q13496 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MTM1Q13496 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTM1Q13496 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTM1Q13496 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTM1Q13496 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
MTM1Q13496 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTM1Q13496 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MTM1Q13496 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTM1Q13496 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTM1Q13496 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTM1Q13496 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTM1Q13496 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTM1Q13496 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTM1Q13496 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MTM1Q13496 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTM1Q13496 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTM1Q13496 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MTM1Q13496 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTM1Q13496 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MTM1Q13496 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms