Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
FOXE3Q13461 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
FOXE3Q13461 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FOXE3Q13461 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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