Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MSLNQ13421 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSLNQ13421 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MSLNQ13421 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MSLNQ13421 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MSLNQ13421 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MSLNQ13421 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MSLNQ13421 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MSLNQ13421 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MSLNQ13421 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MSLNQ13421 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MSLNQ13421 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MSLNQ13421 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MSLNQ13421 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
MSLNQ13421 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSLNQ13421 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MSLNQ13421 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
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