Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
GRIN2BQ13224 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
GRIN2BQ13224 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC40.61■■■■■ 4.09
GRIN2BQ13224 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
GRIN2BQ13224 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC40.61■■■■■ 4.09
GRIN2BQ13224 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
GRIN2BQ13224 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
GRIN2BQ13224 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
GRIN2BQ13224 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
GRIN2BQ13224 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC40.59■■■■■ 4.09
GRIN2BQ13224 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
GRIN2BQ13224 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
GRIN2BQ13224 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
GRIN2BQ13224 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
GRIN2BQ13224 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC40.58■■■■■ 4.09
GRIN2BQ13224 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
GRIN2BQ13224 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.08
GRIN2BQ13224 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
GRIN2BQ13224 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC40.57■■■■■ 4.08
GRIN2BQ13224 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
GRIN2BQ13224 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC40.56■■■■■ 4.08
GRIN2BQ13224 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
GRIN2BQ13224 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC40.56■■■■■ 4.08
GRIN2BQ13224 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC40.56■■■■■ 4.08
GRIN2BQ13224 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC40.56■■■■■ 4.08
GRIN2BQ13224 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC40.55■■■■■ 4.08
GRIN2BQ13224 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
GRIN2BQ13224 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC40.55■■■■■ 4.08
GRIN2BQ13224 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC40.54■■■■■ 4.08
GRIN2BQ13224 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
GRIN2BQ13224 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
GRIN2BQ13224 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC40.54■■■■■ 4.08
GRIN2BQ13224 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
GRIN2BQ13224 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC40.53■■■■■ 4.08
GRIN2BQ13224 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC40.53■■■■■ 4.08
GRIN2BQ13224 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.53■■■■■ 4.08
GRIN2BQ13224 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC40.52■■■■■ 4.08
GRIN2BQ13224 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC40.52■■■■■ 4.08
GRIN2BQ13224 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
GRIN2BQ13224 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
GRIN2BQ13224 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC40.51■■■■■ 4.08
GRIN2BQ13224 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.07
GRIN2BQ13224 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
GRIN2BQ13224 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC40.5■■■■■ 4.07
GRIN2BQ13224 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
GRIN2BQ13224 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC40.49■■■■■ 4.07
GRIN2BQ13224 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
GRIN2BQ13224 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
GRIN2BQ13224 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC40.48■■■■■ 4.07
GRIN2BQ13224 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC40.48■■■■■ 4.07
GRIN2BQ13224 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
GRIN2BQ13224 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
GRIN2BQ13224 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
GRIN2BQ13224 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC40.47■■■■■ 4.07
GRIN2BQ13224 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
GRIN2BQ13224 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
GRIN2BQ13224 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC40.46■■■■■ 4.07
GRIN2BQ13224 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC40.46■■■■■ 4.07
GRIN2BQ13224 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
GRIN2BQ13224 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
GRIN2BQ13224 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
GRIN2BQ13224 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
GRIN2BQ13224 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
GRIN2BQ13224 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
GRIN2BQ13224 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
GRIN2BQ13224 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC40.45■■■■■ 4.07
GRIN2BQ13224 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC40.44■■■■■ 4.06
GRIN2BQ13224 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC40.44■■■■■ 4.06
GRIN2BQ13224 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC40.44■■■■■ 4.06
GRIN2BQ13224 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
GRIN2BQ13224 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC40.43■■■■■ 4.06
GRIN2BQ13224 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC40.42■■■■■ 4.06
GRIN2BQ13224 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC40.42■■■■■ 4.06
GRIN2BQ13224 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.42■■■■■ 4.06
GRIN2BQ13224 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
GRIN2BQ13224 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC40.4■■■■■ 4.06
GRIN2BQ13224 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
GRIN2BQ13224 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
GRIN2BQ13224 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
GRIN2BQ13224 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
GRIN2BQ13224 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
GRIN2BQ13224 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
GRIN2BQ13224 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
GRIN2BQ13224 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.39■■■■■ 4.06
GRIN2BQ13224 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
GRIN2BQ13224 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
GRIN2BQ13224 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
GRIN2BQ13224 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
GRIN2BQ13224 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.06
GRIN2BQ13224 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC40.38■■■■■ 4.05
GRIN2BQ13224 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
GRIN2BQ13224 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC40.36■■■■■ 4.05
GRIN2BQ13224 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC40.36■■■■■ 4.05
GRIN2BQ13224 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
GRIN2BQ13224 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC40.35■■■■■ 4.05
GRIN2BQ13224 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.34■■■■■ 4.05
GRIN2BQ13224 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC40.34■■■■■ 4.05
GRIN2BQ13224 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
GRIN2BQ13224 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC40.33■■■■■ 4.05
GRIN2BQ13224 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
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