Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SEMA3BQ13214 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SEMA3BQ13214 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SEMA3BQ13214 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3BQ13214 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3BQ13214 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3BQ13214 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3BQ13214 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3BQ13214 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3BQ13214 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3BQ13214 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEMA3BQ13214 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3BQ13214 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3BQ13214 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3BQ13214 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3BQ13214 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3BQ13214 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEMA3BQ13214 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3BQ13214 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3BQ13214 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEMA3BQ13214 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3BQ13214 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3BQ13214 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3BQ13214 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SEMA3BQ13214 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA3BQ13214 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEMA3BQ13214 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEMA3BQ13214 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SEMA3BQ13214 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3BQ13214 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3BQ13214 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3BQ13214 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3BQ13214 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3BQ13214 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SEMA3BQ13214 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA3BQ13214 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA3BQ13214 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SEMA3BQ13214 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA3BQ13214 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SEMA3BQ13214 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SEMA3BQ13214 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3BQ13214 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3BQ13214 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3BQ13214 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3BQ13214 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3BQ13214 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SEMA3BQ13214 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA3BQ13214 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA3BQ13214 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA3BQ13214 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA3BQ13214 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SEMA3BQ13214 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3BQ13214 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3BQ13214 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SEMA3BQ13214 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
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