Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXF1Q12946 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXF1Q12946 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXF1Q12946 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXF1Q12946 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXF1Q12946 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXF1Q12946 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXF1Q12946 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FOXF1Q12946 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXF1Q12946 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXF1Q12946 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FOXF1Q12946 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXF1Q12946 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXF1Q12946 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXF1Q12946 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXF1Q12946 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXF1Q12946 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXF1Q12946 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXF1Q12946 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXF1Q12946 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXF1Q12946 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXF1Q12946 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FOXF1Q12946 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXF1Q12946 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXF1Q12946 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXF1Q12946 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXF1Q12946 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXF1Q12946 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FOXF1Q12946 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXF1Q12946 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXF1Q12946 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXF1Q12946 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXF1Q12946 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXF1Q12946 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FOXF1Q12946 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXF1Q12946 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXF1Q12946 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXF1Q12946 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXF1Q12946 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FOXF1Q12946 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXF1Q12946 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXF1Q12946 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXF1Q12946 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FOXF1Q12946 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
FOXF1Q12946 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FOXF1Q12946 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FOXF1Q12946 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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