Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
TP53BP1Q12888 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TP53BP1Q12888 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TP53BP1Q12888 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms