Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SCAPQ12770 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCAPQ12770 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCAPQ12770 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SCAPQ12770 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SCAPQ12770 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SCAPQ12770 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SCAPQ12770 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAPQ12770 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAPQ12770 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAPQ12770 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAPQ12770 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAPQ12770 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAPQ12770 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAPQ12770 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SCAPQ12770 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAPQ12770 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAPQ12770 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAPQ12770 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SCAPQ12770 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAPQ12770 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAPQ12770 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAPQ12770 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAPQ12770 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAPQ12770 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SCAPQ12770 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCAPQ12770 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCAPQ12770 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCAPQ12770 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SCAPQ12770 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAPQ12770 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SCAPQ12770 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SCAPQ12770 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAPQ12770 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAPQ12770 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAPQ12770 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SCAPQ12770 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAPQ12770 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAPQ12770 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAPQ12770 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAPQ12770 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAPQ12770 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAPQ12770 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAPQ12770 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAPQ12770 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAPQ12770 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAPQ12770 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAPQ12770 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAPQ12770 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAPQ12770 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAPQ12770 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAPQ12770 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAPQ12770 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAPQ12770 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAPQ12770 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAPQ12770 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAPQ12770 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAPQ12770 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAPQ12770 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAPQ12770 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAPQ12770 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAPQ12770 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAPQ12770 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAPQ12770 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAPQ12770 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCAPQ12770 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCAPQ12770 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCAPQ12770 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCAPQ12770 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCAPQ12770 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCAPQ12770 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAPQ12770 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAPQ12770 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAPQ12770 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAPQ12770 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAPQ12770 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAPQ12770 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAPQ12770 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAPQ12770 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAPQ12770 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAPQ12770 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAPQ12770 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAPQ12770 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAPQ12770 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SCAPQ12770 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAPQ12770 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAPQ12770 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAPQ12770 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAPQ12770 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SCAPQ12770 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SCAPQ12770 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SCAPQ12770 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.5 ms