Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI6

SLC38A11, Putative sodium-coupled neutral amino acid transporter 11, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A11Q08AI6 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC38A11Q08AI6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC38A11Q08AI6 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC38A11Q08AI6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC38A11Q08AI6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC38A11Q08AI6 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SLC38A11Q08AI6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC38A11Q08AI6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC38A11Q08AI6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC38A11Q08AI6 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC38A11Q08AI6 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC38A11Q08AI6 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC38A11Q08AI6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC38A11Q08AI6 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SLC38A11Q08AI6 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC38A11Q08AI6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC38A11Q08AI6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC38A11Q08AI6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
SLC38A11Q08AI6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC38A11Q08AI6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC38A11Q08AI6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC38A11Q08AI6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC38A11Q08AI6 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC38A11Q08AI6 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
SLC38A11Q08AI6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC38A11Q08AI6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC38A11Q08AI6 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC38A11Q08AI6 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC38A11Q08AI6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC38A11Q08AI6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC38A11Q08AI6 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC38A11Q08AI6 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
SLC38A11Q08AI6 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
SLC38A11Q08AI6 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
SLC38A11Q08AI6 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms